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          格鲁吉亚的影响 Science & Technology

          研究人员解决了微生物拼图

          文轩忠,统计的教授和主任UGA大数据分析实验室

          微生物生态系统 - 微生物之间的关系 和他们的环境,包括在人体内的 - 在人类健康有重要作用。通过诊断测试和基因分析,研究人员可以追踪这个生态系统的破坏是如何导致问题,从哮喘和过敏肥胖和糖尿病。目前用于分析数据的过程是劳动密集型的,往往效率低下。数据的绝对量可能难以管理。一些细菌是脆弱的,死的微生物减少的信息的研究人员可以得到的外部。

          现在,由美国国家科学基金会资助的佐治亚大学的研究人员新项目可能会导致新的计算工具,进一步了解和识别微生物的复杂的妆。

          “宏基因组数据 - 和代谢物组数据 - - 独特的化学指纹该特定细胞过程留下 - 材料从环境样品中直接回收现在通常单独分析,并且每个提供不同类型的上代谢物信息,说:”文选钟,教授统计和UGA大数据分析实验室主任。 “我们想开发计算方法的数据结合起来,研究微生物物种和表型之间的联系。通过将这些数据,我们可以研究微生物系统是如何影响人类的健康。”

          这些新的计算方法将利用metagen,由忠的,可以同时识别微生物种类和估算其丰富的多个样本的研究小组开发了一种工具。

          钟和她的团队将建立一套新的统计框架和计算策略,以有效整合宏基因组和代谢组学数据。解释微生物生态系统和人类的一些疾病之间的关系,他们将开发一个新的统计测试,以确定相关的某些疾病,与疾病有关的微生物物种菌株。创新的联合分析方法将检测微生物物种和微生物组人的交互内的相互作用。

          “有许多潜在的领域,其中我们的新方法可以帮助改善这两种生物和统计分析的过程”,说钟。 “例如,我们可以帮助设计了精确的疾病诊断的新生物标记,对益生菌补充剂提供了潜在的机会,并制定医疗干预策略。”

          该项目代表了有希望的可能性,以及新的挑战大数据领域的一个新的方向。

          “这好比是解决一个拼图。难度不解决一个谜,但是,解决谜题数千名在同一时间全部混合在一起。我们必须拉开件,在正确的组重新组合,说:”钟。 “我们必须为了在同一领域有利于其他研究人员建立了坚实的基础。”

          “美国国家科学基金会支持,为我们打开了许多机会。具体而言,对于这个项目,我们的研究过程中可能会导致在统计和机器学习研究的基础的进步,说:”钟。 “我们计划不仅结合不同的数据科学工具,还建立新的和创新的数据科学的研究过程。”

          钟的研究团队包括统计博士生王晔和mengrui张。该工作由津贴从国家科学基金会的数学科学部门的支持。

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